ผู้ป่วยที่สั่งยาปฏิชีวนะในโรงพยาบาลมีแนวโน้มที่จะติดเชื้อรามากขึ้นเนื่องจากการหยุดชะงักของระบบภูมิคุ้มกันในลำไส้ การใช้ยากระตุ้นภูมิคุ้มกันควบคู่ไปกับยาปฏิชีวนะสามารถลดความเสี่ยงต่อสุขภาพจากการติดเชื้อที่ซับซ้อนเหล่านี้ได้ การติดเชื้อราที่คุกคามชีวิตซึ่งคุกคามชีวิตเป็นภาวะแทรกซ้อนที่สำคัญสำหรับผู้ป่วยในโรงพยาบาลที่ได้รับยาปฏิชีวนะเพื่อป้องกันภาวะติดเชื้อ
การติดเชื้อแบคทีเรียอื่น ๆ ที่แพร่กระจายอย่างรวดเร็วทั่วโรงพยาบาล การติดเชื้อราสามารถรักษาได้ยากกว่าการติดเชื้อแบคทีเรีย แต่ปัจจัยพื้นฐานที่ก่อให้เกิดการติดเชื้อเหล่านี้ไม่เป็นที่เข้าใจกันดีนัก ยาปฏิชีวนะทำลายระบบภูมิคุ้มกันในลำไส้ ซึ่งหมายความว่าการติดเชื้อราในบริเวณนั้นควบคุมได้ไม่ดี โดยไม่คาดคิด ทีมงานยังพบว่าบริเวณที่เกิดการติดเชื้อรา แบคทีเรียในลำไส้สามารถหลบหนีได้ ซึ่งนำไปสู่ความเสี่ยงที่เพิ่มขึ้นของการติดเชื้อแบคทีเรียศักยภาพของยากระตุ้นภูมิคุ้มกัน แต่นักวิจัยยังกล่าวอีกว่างานของพวกเขายังเน้นว่ายาปฏิชีวนะสามารถมีผลเพิ่มเติมต่อร่างกายของเราที่ส่งผลต่อการต่อสู้กับการติดเชื้อและโรคได้อย่างไร สิ่งนี้เป็นการเน้นย้ำถึงความสำคัญของการดูแลยาปฏิชีวนะที่มีอยู่อย่างระมัดระวัง